1.工会财务是以工会为会计主体，其作用之一是为企业或行政事业单位会计主体提供会计数据。但现有电算化条件使财务数据的传递和共享性差，不能满足信息时代对信息传输和处理的要求，同时不能满足财政机关和上级工会组织对资金的收支实现远程监督。
2.会计电算化存在有法不依、违法不纠的现象。我国有关电算化的法规文件有：《工会法》、《工会章程》、《基层工会经费使用管理办法》、《工会经费开支范围》、《会计电算化管理办法》、《商品化会计核算软件评审规则》、《会计核算软件基本功能规范》等，这标志我国的工会会计电算化工作已纳入法制化轨道。但在执行过程中存在有法不依、监管不严，存在违法现象及隐患。
3.由于工会会计电算化在不同行业中均会存在，使得使用的软件形式和功能很难统一；造成各种财务软件的数据接口、使用方法不一样，从而导致报表汇总、数据查询、传输的不方便。有的单位工会使用的软件是商品化会计软件，如《工会之星》、金蝶软件；而有的单位使用的是自行开发的财务软件。
4.由于工会会计的特殊性，使得在财务电算化开展中的职能分工不能过细，甚至有些工会没有进行工会财务电算化的分工，造成内部控制制度无法实施，基层工会的经费审查委员会无法发挥作用。
5.在实施工会财务电算化时，有关的电算化管理体系建立不完善或制度执行不力。具体表现为：数据备份隐患多，硬件软件管理不规范，从事电算化的人员政治和业务素质不高等。
二、电算化会计信息系统环境的完善
1.组织与管理控制。通过部门的设置、人员的分工、岗位职责的制定、权限的划分等形式进行的控制，基本目标是建立恰当的组织机构和职责分工制度，以达到相互牵制、相互制约、防止或减少错弊发生的目的。
2.加强会计电算化专业人才培养。由于会计电算化是一门融计算机学、管理学、会计学、信息学于一体的应用技术，虽然大多数会计人员已接受计算机等级培训，但与实际应用能力要求还有较大差距。
三、我国会计电算化的发展方向
1.会计电算化系统逐步完善。一是软件适应性增强、功能增加增大。智能化会计软件将具有一定的分析能力，能够从现有信息中分析出其真实的含义，判断这些信息对企业的作用，能够根据具有的信息和条件，主动触发相应的系统运行机构，作出处理，智能化会计软件在技术上具有相当大的难度，同时具有广阔的应用前景和学术价值。
二是开发出管理型会计信息系统并应用。
2.会计电算化网络化、国际化。
（1）会计软件的网络化、国际化。会计软件的网络化实际上已经实现，但目前仅限于局域网，信息传输的范围有限，影响了电算化效能的发挥，未来的会计电算化将向着过程网的方向发展，信息传输范围大大增加，使会计信息的异地共享成为可能。网络化有以下特点：①实现企业内部的会计信息共享，对企业进行纵向管理，通过网络将分公司的会计信息传输到上一级公司直到总公司，使总公司对其整个企业的管理力度大大加强。②实现企业与外部相关机构的信息共享，例如，企业与税务、工商管理、海关、审计等部门的联网，将企业的会计信息直接从网上传输出去，使有关部门及时获得可靠信息，提高办公效率，减低信息失真。
论我国会计电算化发展的新趋势
企业会计电算化内部控制现状与对策