１.安全性。网络空间虽然广阔，但同时存在自身的弱点，即网络病毒、黑客攻击等安全问题。但目前的网络安全技术完全可以作到有效防范黑客攻击。从发生的黑客袭击网站事件及病毒感染的情况看，主要存在三类问题：一是管理问题，管理人员、使用人员安全意识淡薄，下载文件不作安全技术检测。二是对一个安全性要求不高的网站，使用防火墙软件显得成本比较昂贵，加上自身软件存在漏洞，为黑客攻击网站提供了可能。三是由于程序设计缺陷及使用者自身的素质问题，容易产生一些系统性的问题。
２.法律及会计制度的滞后性的制约。其直接的滞后性表现在缺少能够使计算机确保自身安全、健康发展的法律制度；间接的滞后性表现在现有的经济法规不能适应网络会计的发展。以网上银行为例，网上支付业务是以变码印签作为安全支付保证，而传统的支付方式是以传统的印签作为安全付款保证，而《票据法》仅对传统的印签作了明确具体规定。所以一旦出了问题，银行能否得到法律的保护还存在问题。对企业而言，使用网上银行得到的原始凭证又不同于传统的银行回单，在账务处理时，特别在进行销项税金抵扣时能否得到税务等监管部门的认可，所有这些都会给网络会计日后的发展带来较大的不确定性。
３.财务监督管理工作的不同步对网络会计的制约作用。由于网络经济发展给财务监督工作提出较高的要求，有些管理人员不愿面对自己将要被淘汰的现实，很难主动作出适应经济发展的举措，很可能利用原有的不适时条文法规人为地阻挠新型业务的发展。
４.“复合型”人才缺乏对网络会计发展的影响。由于网络会计作为网络与会计相结合的高科技产物，对相应的会计人员、管理人员的素质要求较高，既要求他们精通计算机网络知识、基本的故障排除方法以及计算机的基本维护技能，又要求他们具有很深的会计理论功底和娴熟的会计业务技能，人才的匮乏是制约网络会计发展的又一重要原因。
五、政府有关部门应采取的对策政府应针对以上存在的问题及时调整思路，因势利导，既促进网络业务的发展，又不削弱财务监管力量。为此提出几点建议：
１.健全法律制度，完善配套措施。通过法律给该项业务提供健康、良好、宽松的社会发展环境。进一步完善以税务等监管部门为主体的配套的电子发票的电子商务配套业务，以专业物流管理配置部门为主体的电子出入库、提单等电子单据业务。
２.实施网络监控，强化财务监管。即用网络的手段来管理网络经济，包括以下几方面：１使用电子发票，把双方交易信息传递给税务部门申领发票，有效地抑制了大头小尾发票的泛滥，使监控部门有充分的主动权。２实行专业化的物流配售管理，财务监管部门与物流部门实施联网。专业化的物流管理不仅可以节省社会成本，还可以提高电子商务下的货物配送效率，有利于控制赊销、易货、现金销售等形式下的税款流失。３实现财务监管部门与银行的联网，有利于监管部门对资金流动的监管，有利于资金与物流不对称流动带来的税款流失。
３.政府搭台、企业唱戏。政府搭台主要是解决单一企业无法解决而必须解决的问题，主要指政府应建立专业化的物流管理部门，建立信用风险基金，推动电子商务的快速发展。从目前的情况看，不论是Ｂ--B业务还是B--C业务，物流的配送、商业信用始终是制约电子商务发展的一个很尖锐的问题。
４.在教育领域加强复合型人才的培养，促进网络化进程。社会的进步、企业的发展归根结底都需要高素质的人来完成，没有高素质的人才，网络会计就成了无本之木、无源之水。
互联网下会计电算化内部控制研究
会计电算化应用中存在的问题及对策