由于“反复核、反记账、反结账”功能的使用，使得会计人员为同一单位做几套账、编制几套会计报表变得轻而易举。以前手工账由各人分别编制凭证、记载账簿，如果发生会计造假，通过墨迹或笔迹可以较容易地识别和鉴定。而目前大多数会计软件对更改的会计事项没有提供完整的、真正意义上的痕迹记录。有的会计软件根本不提供这类逆向会计操作的痕迹记录，有的也只是在操作日志中记录了何人何时使用过这些逆向操作功能，至于更正和补充了何种会计事项，其目的和来龙去脉如何则无从得知。现在，会计凭证、报表、账册都可以通过计算机打印出来，如果单位缺乏严格周密的会计电算化内部牵制手续，别有用心的人就会在会计业务发生时蓄意留下伏笔，经过一段时间后，神不知鬼不觉地篡改部分会计凭证、报表和账册，这样就使得会计做假、造假和经济违法犯罪变得更加隐蔽，给会计、审计监督工作和防范违法犯罪增加了技术难度。
3.如果软件功能使用不当，可能会导致账务混乱
在使用“反记账、反结账”功能时，由于财会人员会计电算化业务水平以及对软件功能理解的偏差，特别是在运用跨年度反结账功能时，不同年份会计科目的体系可能发生了变化，如果误操作，很可能产生账务混乱，甚至可能导致整个账务系统的瘫痪，造成不应有的损失。
三、完善措施
通过分析不难发现，会计电算化工作中的“反复核、反记账、反结账”并非十全十美，也不是一无是处，对其正确的态度简单地说就是“去偏存真，加栅防护”。
1.“去偏存真”就是去掉那些不合规的功能，保留有用且合规的功能。这是因为：在日常会计核算工作中，无论是手工操作还是会计电算化核算，存在差错是在所难免的，其差错必须通过规范的会计差错更正方法来纠正。会计电算化工作可能产生的差错，归纳起来主要有以下5种类型：一是会计科目运用错误；二是发生额多记或少记；三是编制记账凭证时借贷方用错；四是有关经济事项没有完整反映；五是会计摘要或原始凭证附件数量发生录入差错等。至于在手工会计核算中出现的诸如借贷不平衡、会计账簿登载笔误、跳行、隔页等差错，由于计算机自动记账、结账，已不可能再出现。在手工会计核算常用的会计差错更正方法中，除“红字划线更正法”不再适用会计电算化核算外，其他如“红字冲销法”、“补充更正法”依然适用于会计电算化核算，以上提及的5种类型的差错基本都可通过这两种方法进行更正，而且在《会计核算软件基本功能规范》中已有非常明确的规定。此外，关于冗余会计信息问题，相对于整个会计核算工作而言，发生会计差错的数量毕竟是有限的，不会出现有的同志担心的形成大量冗余会计信息的情况，而且通过规范的会计差错更正方法更正以后，不会影响到会计信息的质量及其使用，会计账簿、会计报表完全能够做到真实、完整、准确地反映企业的财务状况和经营成果。
2.加栅防护
当前，会计工作中普遍存在着会计信息失真和会计造假的问题，已经成为阻碍我国经济发展的毒瘤。而利用会计电算化“反复核、反记账、反结账”功能做假、造假正变得越来越普遍，从一定程度上讲，起到了助纣为虐的作用。国家有关会计法规对会计差错更正方法的规定，都强调了更正会计差错要有痕迹记录，其目的就是要做到有案可稽，有据可查，从制度上防止会计做假造假，不给犯罪分子以可乘之机。因此，从加强会计电算化法规建设、堵塞制度漏洞和提高会计信息质量的角度讲，会计电算化工作的主管机关一一财政部对会计核算软件“反记账、反结账”功能要作出“加栅防护”的明确规定。对可以实施的逆向会计操作功能，会计软件必须要提供能够反映经济事项来龙去脉的痕迹记录功能；明令禁止会计软件提供具有会计舞弊功能性质的跨年度“反结账”功能；对会计人员利用“反记账、反结账”功能从事做账、造假等违法犯罪活动，要制定相应的处罚规定。通过严密法规和道德制度建设，促进财会人员遵章守纪，加强规范的职业道德教育，使会计电算化真正达到朱镑基总理提出的“诚信为本、操守为重、遵循准则、不做假账”的要求。
我国电算化会计与电算化审计的比较分析
对会计电算化发展现状的思考