一是准确把握预算执行中政府采购审计的特点
预算执行中的政府采购审计，是适应我国财政支出管理改革与政府管理职能转变的需要，在以往财务收支审计的基础上，逐步建立和发展起来的一项崭新工作。因此，预算执行中政府采购审计除了具备一般财务收支审计的基本特点外，还具有自身独特之处。
首先预算执行中的政府采购审计不是一项独立的审计项目，而是根据被审计单位实际情况，结合部门预算执行审计和其他行政事业单位财政财务收支审计一并进行的审计，可以说政府采购审计是财政预算支出审计的一项重要内容。
其次预算执行中政府采购审计是一项全过程全方位的综合审计。政府采购要求财政资金从分配环节向使用环节延伸，由价值领域向实物领域延伸。相应政府采购审计也必须按采购程序和资金走向实施全过程全方位的追踪审计，既要关注财政资金的价值形态和物质形态，又要关注财政资金运作过程和使用结果，还要关注与政府采购项目相关的各种专项资金。但这并不是要求把政府采购的每个环节都纳入审计视野，而是要根据预算执行审计的特点和要求来具体确定预算执行中政府采购的审计内容。
二是牢牢抓住预算执行中政府采购审计的重点
预算执行中的政府采购审计涉及面较广，专业性较强。为有效发挥审计监督在预算执行中政府采购中的作用，审计人员应以被审计单位执行《政府采购法》和相关规章制度的情况作为审计的切入点和着力点展开审计，并重点关注如下几个方面：
（一）关注政府采购的预算编制。主要检查政府采购预算编制依据是否充分有效，是否遵循规定的程序，是否单独编报；并审查纳入政府采购预算的范围是否正确；预算是否细化，是否存在编造虚假预算骗取财政资金的行为；政府采购预算批复是否及时，其追加或调减的审批手续是否合规等等，以强化预算约束，促使被审计单位加强预算管理。
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