针对税收政策的规定和实际企业工程总承包的特点，企业在境外缴纳所得税税款后，应取得相应的凭据，即代扣代缴凭证或纳税凭证，然后按照不同国别进行抵免。中国目前的政策规定是限额抵扣法，即扣除的限额是其来源于境外的所得按中国税法规定计算的应纳税额。
2.进行境外所得税抵免的步骤和要点。
（1）分析签订的总承包合同，一般在合同中的税收和费用条款中会明确规定，在国外的税收由业主来负担。另外还要关注是否可在合同执行期中，有当地的税务机关出具纳税（包括代扣代缴）或免税的凭证或证明。
（2）按照工程所在地法律和规则要求，在当地办理注册税务登记手续，选择不同的会计系统，项目的所得税按照当地的税法要求进行预缴，可根据当地的税收管理要求预缴半年或一年。
（3）预缴税款后，应取得预缴所得税的纳税凭证或免税证明。
（4）按照计算公式分国别计算境外所得税税款扣除限额。
（5）虽然境内外业务在财务上是分别核算，预缴也按照各自规定进行，但是每年在汇算清缴时，要将境内外业务合并计算。
3.需要注意的几个问题。
（1）关于减免税的问题，如果总承包商在与中国缔结避免双重征税协定的国家，按照所在国家（地区）的税法规定获得的减免所得税待遇，工程总承包商应提供有关证明，报主管税务机关审核后，视同已缴税款准予抵免。这一点对于工程承包业务比较重要，因为大多数的工程总承包合同约定，在工程当地的任何税费全部由业主承担。这样的描述从合同双方的角度看，显然不能免除承包商的纳税义务，因为即使在境外免税或由业主负担该项税收，如果不能提供要求业主取得当地主管税务机关的证明，也需要到国内进行补缴所得税税款。
（2）工程总承包商在境外已缴纳的所得税税款低于计算出的该国境外所得税税款扣除限额的，应从应纳税总额中按实际扣除；超过境外所得税税款扣除限额的，应按计算出的扣除限额进行扣除，其超过部分，当年不能扣除，但可以在不超过5年的期限内，用以后年度税款扣除限额的余额补扣。
（3）对于总承包合同中约定的关于双方的税收义务责任，因为一般的合同条款约定都是境外的任何税费由业主来承担，总承包商得到的是除税以外的净额。但是如果要进行所得税的抵扣，必须取得相应的纳税证明或免税证明，因此在合同签订的前期，应进行税收筹划，要求业务部门将取得一定的纳（免）税证明放在合同条款的业主责任中，由业主协助公司取得当地税务机关的书面证明。这样才可以办理相应的境外所得税抵扣程序，所以需要特别注意。对于代扣代缴的，因为作为总承包商没有直接与当地税务机关发生关系，需要业主配合取得代扣代缴税款凭证，作为抵扣所得税的依据。
（4）对于总承包合同，如果签订时是包税的，即总承包商的所得税或是由业主代扣代缴，或是直接按照对于总承包商的税收优惠进行减免，这种情况需要特别关注。目前新的企业所得税法，还没有就所得税的饶让进行特别的规范，以上的代扣代缴或税收优惠是否可等同已缴税款，需要进一步与我国的税务机关进行明确。
所得税盈余管理研究综述及启示 (1)
我国税制结构分析及选择 ．