作者:于琦, 牛昀, 丁秀敏, 于泳, 史玉荣, 肖绪祺
【关键词】 乳腺肿瘤; 克隆性检测; 聚合酶链反应; 普通PCR; 巢式PCR
0 引言
根据肿瘤的单克隆性,我们曾采用巢式PCR扩增DNA,用于研究乳腺癌癌前病变的早期诊断。我们将克隆性检测中所用聚合酶链反应的两种方法—普通PCR(GPCR)和巢式PCR(NPCR)的检测结果做一比较,以期找到更为简便、实用的方法。
1 资料与方法
1.1 临床资料
选择天津医科大学肿瘤医院乳腺病理室2000~2004年间存档的乳腺一般性增生(Usual ductal hyperplasia, UDH)和/外周型乳头状瘤(Peripapilloma, periPM)、不典型增生(Atypical ductal hyperplasia,ADH)和/periPM伴ADH及导管内癌 (Ductal carcinoma in situ, DCIS)石蜡包埋组织各30例,正常组织20例,均为女性,年龄19~72岁(中位49岁)。
1.2 研究方法
1.2.1 GPCR反应 按朱少君等[1]报告的方法,提取DNA,并取1μg,按反应体系(HhaⅠ内切酶1μl、10×M缓冲液2μl、牛血清蛋白0.2μl加灭菌水至20μl) 37℃消化3h,65℃ 20min终止反应,自然冷却。取消化后的DNA10μl,加Premix Taq 25μl、引物AR1A和AR1B各2.2μl、加灭菌水至50μl反应体系(未经消化的DNA按以下公式换算:所加DNA(μl)=1/2消化时所需DNA(μl),再用灭菌水补足10μl)。按反应条件:97℃预变性7 min、94℃变性40s、56℃退火50s、72℃延长1min,共35个循环, 72℃延长15min。
1.2.2 NPCR反应 取5μl GPCR扩增产物,用灭菌水稀释至500μl,然后取10μl稀释的DNA加引物AR2A和AR2B(反应体系同GPCR加至50μl)进行NPCR反应(反应条件同GPCR)。 AR1A:5’GAGGAGCTTTCCAGAATCTG 3’; AR1B:5’CATGGGCTTGGGGAGA 3’; AR2A:5’TCCAGAATCTGTTCCAGAGC 3’; AR2B:5’TGGGGAGAACCATCCTCACC 3’
1.2.3 琼脂糖凝胶电泳评价扩增效果,变性聚丙烯酰胺凝电泳,比较GPCR和NPCR的结果。
1.2.4 统计学分析采用配对四格表χ2检验。
2 结果
2.1 琼脂糖凝胶电泳显示GPCR扩增条带清晰,与NPCR相同,见图1。
2.2 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳比较扩增情况
正常组织、UDH和/ periPM酶切前后无明显变化,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳在200bp与300bpDNA泳动位置间显示2条带,说明具有AR位点的多态性,是多克隆的;导管内癌组酶切后两条带中的1条明显减弱或消失,显示出X染色体失活嵌合性的丢失,属于单克隆性增生;在ADH和/periPM伴ADH样本中,一部分显示多克隆的,而一部分是单克隆的。分别用NPCR、GPCR扩增产物进行以上实验过程,并逐例比较经NPCR和GPCR后在电泳图上显示的带型。两种方法均扩增成功的样本电泳结果相似,显示扩增效果是一致的,见图2。